Циклофілін A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB

1AK4, 1AWQ, 1AWR, 1AWS, 1AWT, 1AWU, 1AWV, 1BCK, 1CWA, 1CWB, 1CWC, 1CWF, 1CWH, 1CWI, 1CWJ, 1CWK, 1CWL, 1CWM, 1CWO, 1FGL, 1M63, 1M9C, 1M9D, 1M9E, 1M9F, 1M9X, 1M9Y, 1MF8, 1MIK, 1NMK, 1OCA, 1RMH, 1VBS, 1VBT, 1W8L, 1W8M, 1W8V, 1YND, 1ZKF, 2ALF, 2CPL, 2CYH, 2MZU, 2N0T, 2RMA, 2RMB, 2X25, 2X2A, 2X2C, 2X2D, 2XGY, 3CYH, 3CYS, 3K0M, 3K0N, 3K0O, 3K0P, 3K0Q, 3K0R, 3ODI, 3ODL, 3RDD, 4CYH, 4IPZ, 4N1M, 4N1N, 4N1O, 4N1P, 4N1Q, 4N1R, 4N1S, 4YUO, 5CYH, 2MS4, 4YUG, 4YUH, 4YUI, 4YUJ, 4YUK, 4YUL, 4YUM, 4YUN, 4YUP, 5F66, 5FJB

Ідентифікатори

Символи

PPIA, CYPA, CYPH, HEL-S-69p, Peptidylprolyl isomerase A

Зовнішні ІД

OMIM: 123840 MGI: 97749 HomoloGene: 134504 GeneCards: PPIA

Реагує на сполуку

циклоспорин^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • virion binding • unfolded protein binding • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • RNA binding • cyclosporin A binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • мембрана • focal adhesion • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • везикула • екзосома • міжклітинний простір • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0019067 viral life cycle • positive regulation of protein secretion • regulation of viral genome replication • uncoating of virus • lipid droplet organization • virion assembly • leukocyte migration • RNA-dependent DNA biosynthetic process • positive regulation of viral genome replication • viral release from host cell • establishment of integrated proviral latency • protein peptidyl-prolyl isomerization • згортання білків • fusion of virus membrane with host plasma membrane • GO:0022415 viral process • neutrophil degranulation • interleukin-12-mediated signaling pathway • protein refolding
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5478


268373

Ensembl


ENSG00000196262


ENSMUSG00000071866

UniProt


P62937


P17742

RefSeq (мРНК)


NM_203431 NM_001300981 NM_021130 NM_203430


NM_008907

RefSeq (білок)


NP_001287910 NP_066953


NP_032933

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.8 – 44.82 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Циклофілін A (англ. Peptidylprolyl isomerase A) – білок, який кодується геном PPIA, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 165 амінокислот, а молекулярна маса — 18 012^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVNPTVFFDI	AVDGEPLGRV	SFELFADKVP	KTAENFRALS	TGEKGFGYKG
SCFHRIIPGF	MCQGGDFTRH	NGTGGKSIYG	EKFEDENFIL	KHTGPGILSM
ANAGPNTNGS	QFFICTAKTE	WLDGKHVVFG	KVKEGMNIVE	AMERFGSRNG
KTSKKITIAD	CGQLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

Haendler B., Hofer E. (1990). Characterization of the human cyclophilin gene and of related processed pseudogenes. Eur. J. Biochem. 190: 477—482. PMID 2197089 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb15598.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu J., Chen C.-M., Walsh C.T. (1991). Human and Escherichia coli cyclophilins: sensitivity to inhibition by the immunosuppressant cyclosporin A correlates with a specific tryptophan residue. Biochemistry. 30: 2306—2310. PMID 2001362 DOI:10.1021/bi00223a003
Luban J., Bossolt K.L., Franke E.K., Kalpana G.V., Goff S.P. (1993). Human immunodeficiency virus type 1 Gag protein binds to cyclophilins A and B. Cell. 73: 1067—1078. PMID 8513493 DOI:10.1016/0092-8674(93)90637-6
Suzuki J., Jin Z.G., Meoli D.F., Matoba T., Berk B.C. (2006). Cyclophilin A is secreted by a vesicular pathway in vascular smooth muscle cells. Circ. Res. 98: 811—817. PMID 16527992 DOI:10.1161/01.RES.0000216405.85080.a6
Ke H., Zydowsky L.D., Liu J., Walsh C.T. (1991). Crystal structure of recombinant human T-cell cyclophilin A at 2.5-A resolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 9483—9487. PMID 1946361 DOI:10.1073/pnas.88.21.9483

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з peptidylprolyl isomerase A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9253 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P62937 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.