LPP

Ідентифікатори

Символи

LPP, LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma

Зовнішні ІД

OMIM: 600700 MGI: 2441849 HomoloGene: 4075 GeneCards: LPP

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння, вітиліго, натуральна віспа, целіакія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • stress fiber
Біологічний процес	• адгезія клітин • GO:0022610 життєдіяльність • cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4026


210126

Ensembl


ENSG00000145012


ENSMUSG00000033306

UniProt


Q93052


Q8BFW7

RefSeq (мРНК)

NM_001167671 NM_001167672 NM_005578 NM_001375455 NM_001375456
NM_001375457 NM_001375458 NM_001375459 NM_001375460 NM_001375461 NM_001375462 NM_001375463 NM_001375464 NM_001375465


NM_001145952 NM_001145954 NM_178665

RefSeq (білок)

NP_001161143 NP_001161144 NP_005569 NP_001362384 NP_001362385
NP_001362386 NP_001362387 NP_001362388 NP_001362389 NP_001362390 NP_001362391 NP_001362392 NP_001362393 NP_001362394


NP_001139424 NP_001139426 NP_848780

Локус (UCSC)

Хр. 3: 188.15 – 188.89 Mb

Хр. 16: 24.39 – 24.99 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LPP (англ. LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 65 746^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHPSWLPPK	STGEPLGHVP	ARMETTHSFG	NPSISVSTQQ	PPKKFAPVVA
PKPKYNPYKQ	PGGEGDFLPP	PPPPLDDSSA	LPSISGNFPP	PPPLDEEAFK
VQGNPGGKTL	EERRSSLDAE	IDSLTSILAD	LECSSPYKPR	PPQSSTGSTA
SPPVSTPVTG	HKRMVIPNQP	PLTATKKSTL	KPQPAPQAGP	IPVAPIGTLK
PQPQPVPASY	TTASTSSRPT	FNVQVKSAQP	SPHYMAAPSS	GQIYGSGPQG
YNTQPVPVSG	QCPPPSTRGG	MDYAYIPPPG	LQPEPGYGYA	PNQGRYYEGY
YAAGPGYGGR	NDSDPTYGQQ	GHPNTWKREP	GYTPPGAGNQ	NPPGMYPVTG
PKKTYITDPV	SAPCAPPLQP	KGGHSGQLGP	SSVAPSFRPE	DELEHLTKKM
LYDMENPPAD	EYFGRCARCG	ENVVGEGTGC	TAMDQVFHVD	CFTCIICNNK
LRGQPFYAVE	KKAYCEPCYI	NTLEQCNVCS	KPIMERILRA	TGKAYHPHCF
TCVMCHRSLD	GIPFTVDAGG	LIHCIEDFHK	KFAPRCSVCK	EPIMPAPGQE
ETVRIVALDR	DFHVHCYRCE	DCGGLLSEGD	NQGCYPLDGH	ILCKTCNSAR
IRVLTAKAST	DL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Petit M.M.R., Mols R., Schoenmakers E.F., Mandahl N., Van de Ven W.J.M. (1996). LPP, the preferred fusion partner gene of HMGIC in lipomas, is a novel member of the LIM protein gene family. Genomics. 36: 118—129. PMID 8812423 DOI:10.1006/geno.1996.0432
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Petit M.M., Swarts S., Bridge J.A., Van de Ven W.J.M. (1998). Expression of reciprocal fusion transcripts of the HMGIC and LPP genes in parosteal lipoma. Cancer Genet. Cytogenet. 106: 18—23. PMID 9772904 DOI:10.1016/S0165-4608(98)00038-7
Rogalla P., Lemke I., Kazmierczak B., Bullerdiek J. (2000). An identical HMGIC-LPP fusion transcript is consistently expressed in pulmonary chondroid hamartomas with t(3;12)(q27-28;q14-15). Genes Chromosomes Cancer. 29: 363—366. PMID 11066083 DOI:10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<1::AID-GCC1043>3.3.CO;2-E
Petit M.M., Meulemans S.M., Van de Ven W.J.M. (2003). The focal adhesion and nuclear targeting capacity of the LIM-containing lipoma-preferred partner (LPP) protein. J. Biol. Chem. 278: 2157—2168. PMID 12441356 DOI:10.1074/jbc.M206106200
Li B., Zhuang L., Reinhard M., Trueb B. (2003). The lipoma preferred partner LPP interacts with alpha-actinin. J. Cell Sci. 116: 1359—1366. PMID 12615977 DOI:10.1242/jcs.00309

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LPP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6679 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q93052 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.