NEIL3

Ідентифікатори

Символи

NEIL3, FGP2, FPG2, NEI3, ZGRF3, hFPG2, hNEI3, nei like DNA glycosylase 3

Зовнішні ІД

OMIM: 608934 MGI: 2384588 HomoloGene: 10094 GeneCards: NEIL3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • damaged DNA binding • каталітична активність • lyase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • DNA N-glycosylase activity • bubble DNA binding • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • single-stranded DNA binding • double-stranded DNA binding • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair • cellular response to DNA damage stimulus • обмін речовин • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55247


234258

Ensembl


ENSG00000109674


ENSMUSG00000039396

UniProt


Q8TAT5


Q8K203

RefSeq (мРНК)


NM_018248


NM_146208

RefSeq (білок)


NP_060718


NP_666320

Локус (UCSC)

Хр. 4: 177.31 – 177.36 Mb

Хр. 8: 54.04 – 54.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NEIL3 (англ. Nei like DNA glycosylase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 67 769^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVEGPGCTLN	GEKIRARVLP	GQAVTGVRGS	ALRSLQGRAL	RLAASTVVVS
PQAAALNNDS	SQNVLSLFNG	YVYSGVETLG	KELFMYFGPK	ALRIHFGMKG
FIMINPLEYK	YKNGASPVLE	VQLTKDLICF	FDSSVELRNS	MESQQRIRMM
KELDVCSPEF	SFLRAESEVK	KQKGRMLGDV	LMDQNVLPGV	GNIIKNEALF
DSGLHPAVKV	CQLTDEQIHH	LMKMIRDFSI	LFYRCRKAGL	ALSKHYKVYK
RPNCGQCHCR	ITVCRFGDNN	RMTYFCPHCQ	KENPQHVDIC	KLPTRNTIIS
WTSSRVDHVM	DSVARKSEEH	WTCVVCTLIN	KPSSKACDAC	LTSRPIDSVL
KSEENSTVFS	HLMKYPCNTF	GKPHTEVKIN	RKTAFGTTTL	VLTDFSNKSS
TLERKTKQNQ	ILDEEFQNSP	PASVCLNDIQ	HPSKKTTNDI	TQPSSKVNIS
PTISSESKLF	SPAHKKPKTA	QYSSPELKSC	NPGYSNSELQ	INMTDGPRTL
NPDSPRCSKH	NRLCILRVVG	KDGENKGRQF	YACPLPREAQ	CGFFEWADLS
FPFCNHGKRS	TMKTVLKIGP	NNGKNFFVCP	LGKEKQCNFF	QWAENGPGIK
IIPGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Torisu K., Tsuchimoto D., Ohnishi Y., Nakabeppu Y. (2005). Hematopoietic tissue-specific expression of mouse Neil3 for endonuclease VIII-like protein. J. Biochem. 138: 763—772. PMID 16428305 DOI:10.1093/jb/mvi168
Krokeide S.Z., Bolstad N., Laerdahl J.K., Bjoras M., Luna L. (2009). Expression and purification of NEIL3, a human DNA glycosylase homolog. Protein Expr. Purif. 65: 160—164. PMID 19121397 DOI:10.1016/j.pep.2008.11.014
Neurauter C.G., Luna L., Bjoras M. (2012). Release from quiescence stimulates the expression of human NEIL3 under the control of the Ras dependent ERK-MAP kinase pathway. DNA Repair. 11: 401—409. PMID 22365498 DOI:10.1016/j.dnarep.2012.01.007

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24573 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TAT5 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.