NGFR

NGFR
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3EWV, 2N80, 2N97, 2N83

Ідентифікатори
Символи NGFR, CD271, Gp80-LTNFRSF16, p75(NTR), p75NTR, nerve growth factor receptor
Зовнішні ІД OMIM: 162010 MGI: 97323 HomoloGene: 1877 GeneCards: NGFR
Онтологія гена
Молекулярна функція

• signal transducer activity
• transmembrane signaling receptor activity
• tumor necrosis factor-activated receptor activity
• ubiquitin protein ligase binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• calmodulin binding
• coreceptor activity
• neurotrophin binding
• nerve growth factor binding
• amyloid-beta binding
• death receptor activity
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• extracellular region
• нуклеоплазма
• integral component of membrane
• гіалоплазма
• integral component of plasma membrane
• neuron projection
• мембрана
• cell surface
• ендосома
• клітинне ядро
• клітинна мембрана

Біологічний процес

• ритмічний процес
• regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• negative regulation of apoptotic process
• neurotrophin TRK receptor signaling pathway
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• axon guidance
• multicellular organism development
• GO:0097285 апоптоз
• negative regulation of axonogenesis
• нейробіологія розвитку
• glucose homeostasis
• positive regulation of axonogenesis
• circadian regulation of gene expression
• membrane protein intracellular domain proteolysis
• диференціація клітин
• inflammatory response
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• intracellular protein transport
• positive regulation of apoptotic process
• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• response to lipopolysaccharide
• apoptotic signaling pathway
• negative regulation of neuron projection development
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• positive regulation of protein localization to nucleus
• positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
• negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis
• Rho protein signal transduction
• cellular glucose homeostasis
• neuron apoptotic process
• cellular response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4804
18053
Ensembl
ENSG00000064300
ENSMUSG00000000120
UniProt
P08138
Q9Z0W1
RefSeq (мРНК)
NM_002507
NM_033217
RefSeq (білок)
NP_002498
NP_150086
Локус (UCSC) Хр. 17: 49.5 – 49.52 Mb Хр. 11: 95.46 – 95.48 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NGFR (англ. Nerve growth factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 45 183[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGAGATGRAMDGPRLLLLLLLGVSLGGAKEACPTGLYTHSGECCKACNLG
EGVAQPCGANQTVCEPCLDSVTFSDVVSATEPCKPCTECVGLQSMSAPCV
EADDAVCRCAYGYYQDETTGRCEACRVCEAGSGLVFSCQDKQNTVCEECP
DGTYSDEANHVDPCLPCTVCEDTERQLRECTRWADAECEEIPGRWITRST
PPEGSDSTAPSTQEPEAPPEQDLIASTVAGVVTTVMGSSQPVVTRGTTDN
LIPVYCSILAAVVVGLVAYIAFKRWNSCKQNKQGANSRPVNQTPPPEGEK
LHSDSGISVDSQSLHDQQPHTQTASGQALKGDGGLYSSLPPAKREEVEKL
LNGSAGDTWRHLAGELGYQPEHIDSFTHEACPVRALLASWATQDSATLDA
LLAALRRIQRADLVESLCSESTATSPV

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, біологічні ритми, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sehgal A., Patil N., Chao M. (1988). A constitutive promoter directs expression of the nerve growth factor receptor gene. Mol. Cell. Biol. 8: 3160—3167. PMID 2850481 DOI:10.1128/MCB.8.8.3160
  • Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6. J. Biol. Chem. 274: 2597—2600. PMID 9915784 DOI:10.1074/jbc.274.5.2597
  • Bai D., Chen H., Huang B.-R. (2003). RanBPM is a novel binding protein for p75NTR. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 552—557. PMID 12963025 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.08.033
  • Chapman B.S., Eckart M.R., Kaufman S.E., Lapointe G.R. (1996). O-linked oligosaccharide on the 75-kDa neurotrophin receptor. J. Neurochem. 66: 1707—1716. PMID 8627329

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7809 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P08138 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350