TPT1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YZ1, 3EBM, 4Z9V, 2HR9

Ідентифікатори

Символи

TPT1-AS1, HRF, TCTP, p02, p23, tumor protein, translationally-controlled 1, TPT1 antisense RNA 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600763 MGI: 104890 HomoloGene: 55730 GeneCards: TPT1-AS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • microtubule binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • multivesicular body • tubulin complex • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма • spindle pole • cytoplasmic microtubule
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • response to virus • cellular calcium ion homeostasis • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • calcium ion transport • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


100190939


22070

Ensembl


ENSG00000170919


ENSMUSG00000060126

UniProt


P13693


P63028

RefSeq (мРНК)


н/д


NM_009429

RefSeq (білок)


NP_001273201 NP_001273202 NP_003286


NP_033455

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 14: 76.08 – 76.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPT1 (англ. Tumor protein, translationally-controlled 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 172 амінокислот, а молекулярна маса — 19 595^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIIYRDLISH	DEMFSDIYKI	REIADGLCLE	VEGKMVSRTE	GNIDDSLIGG
NASAEGPEGE	GTESTVITGV	DIVMNHHLQE	TSFTKEAYKK	YIKDYMKSIK
GKLEEQRPER	VKPFMTGAAE	QIKHILANFK	NYQFFIGENM	NPDGMVALLD
YREDGVTPYM	IFFKDGLEME	KC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Gross B., Gaestel M., Boehm H., Bielka H. (1989). cDNA sequence coding for a translationally controlled human tumor protein. Nucleic Acids Res. 17: 8367—8367. PMID 2813067 DOI:10.1093/nar/17.20.8367
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
MacDonald S.M., Rafnar T., Langdon J., Lichtenstein L.M. (1995). Molecular identification of an IgE-dependent histamine-releasing factor. Science. 269: 688—690. PMID 7542803 DOI:10.1126/science.7542803
Yarm F.R. (2002). Plk phosphorylation regulates the microtubule-stabilizing protein TCTP. Mol. Cell. Biol. 22: 6209—6221. PMID 12167714 DOI:10.1128/MCB.22.17.6209-6221.2002
Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12022 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P13693 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.