LAMP2

LAMP2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2MOF, 2MOM

Идентификаторы
ПсевдонимыLAMP2, CD107b, LAMP-2, LAMPB, LGP110, lysosomal associated membrane protein 2, LGP-96, DND
Внешние IDOMIM: 309060 MGI: 96748 HomoloGene: 7809 GeneCards: LAMP2
Расположение гена (человек)
X-хромосома человека
Хр.X-хромосома человека[1]
X-хромосома человека
Расположение в геноме LAMP2
Расположение в геноме LAMP2
ЛокусXq24Начало120,426,148 bp[1]
Конец120,469,365 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
X-хромосома мыши
Хр.X-хромосома мыши[2]
X-хромосома мыши
Расположение в геноме LAMP2
Расположение в геноме LAMP2
ЛокусX A3.3|X 22.67 cMНачало37,490,234 bp[2]
Конец37,545,331 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • external globus pallidus

  • inferior ganglion of vagus nerve

  • stromal cell of endometrium
Наибольшая экспрессия в
  • conjunctival fornix

  • left lung lobe

  • proximal tubule
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • protein domain specific binding
  • связывание с белками плазмы
  • enzyme binding
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • membrane microdomain
  • эндосома
  • late endosome
  • phagocytic vesicle membrane
  • chaperone-mediated autophagy translocation complex
  • мембрана
  • late endosome membrane
  • клеточная мембрана
  • lysosomal membrane
  • lysosomal lumen
  • platelet dense granule membrane
  • лизосома
  • endosome membrane
  • экзосома
  • autophagosome membrane
  • внеклеточное пространство
  • trans-Golgi network
  • цитоплазматическая везикула
  • azurophil granule membrane
  • autolysosome
  • perinuclear region of cytoplasm
  • integral component of autophagosome membrane
  • ficolin-1-rich granule membrane
  • липидный рафт
  • lysosomal matrix
Биологический процесс
  • regulation of protein stability
  • muscle cell cellular homeostasis
  • protein stabilization
  • platelet degranulation
  • protein import
  • Внутриклеточная сортировка белков
  • аутофагия
  • cellular response to starvation
  • negative regulation of protein homooligomerization
  • neutrophil degranulation
  • chaperone-mediated autophagy
  • protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy
  • autophagosome maturation
  • lysosomal protein catabolic process
  • establishment of protein localization to organelle
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

3920

16784

Ensembl

ENSG00000005893

ENSMUSG00000016534

UniProt

P13473

P17047

RefSeq (мРНК)

NM_013995
NM_001122606
NM_002294

NM_001017959
NM_001290485
NM_010685

RefSeq (белок)

NP_001116078
NP_002285
NP_054701

NP_001017959
NP_001277414
NP_034815

Локус (UCSC)Chr X: 120.43 – 120.47 MbChr X: 37.49 – 37.55 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

LAMP2 (англ. Lysosomal-associated membrane protein 2) — один из важнейших гликопротеинов лизосомальной мембраны. Вместе с другим гомологичным белком LAMP1 составляет около 50 % от всех белков мембраны лизосом. Наличие этих белков считается структурным определением лизосом как внутриклеточных органелл.

Структура

Зрелый белок LAMP2 относится к интегральным трансмембранным белкам, содержит 382 аминокислоты (сигнальный — 28 аминокислот). Белковая часть молекулы имеет молекулярную массу около 40 кДа. Однако в клетке белок сильно гликозилирован так, что его полная масса составляет около 110 кДа, поэтому аналоги этого белка человека многих видов животных называются «110-кДа лизосомальный мембранный гликопротеин» (110-kDa lysosomal membrane glycoprotein, lgp110). LAMP2 содержит 26 участков O- или N-гликозилирования.

Более 90% белковой молекулы LAMP2 находится во внутреннем пространстве лизосомы. Короткий цитозольный фрагмент отличается высоким консерватизмом и сохраняется в практически неизменном виде среди млекопитающих и птиц.

Функции

LAMP2 защищает лизосомальную мембрану от протеолитических ферментов лизосомы. Цитозольный фрагмент белка служит рецептором для белков, которые должны быть доставлены в лизосому из цитоплазмы.

Роль в патологии

Мутации в LAMP2, как правило, приводят к болезни Дэнона (Danon disease) с характерным накоплением аутофагального материала в миоцитах и проявляющейся в первую очередь в первичной кардиомиопатии. Клинические характеристики нарушения LAMP2 — это встречаемость только у мужчин, тяжёлая гипертрофия, раннее проявление (в 8-17 лет) и раннее желудочковое возбуждение, а также асимптоматическое повышение двух белков в плазме крови.

Применение в клеточной биологии

Так как по определению лизосомами считаются внутриклеточные органеллы, которые содержат в своей мембране LAMP1 и LAMP2, оба белка используются как клеточный маркёр лизосом.

См.также

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000005893 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000016534 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

Библиография

  • Eskelinen E.L. Roles of LAMP-1 and LAMP-2 in lysosome biogenesis and autophagy (англ.) // Mol. Aspects Med.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 27, no. 5—6. — P. 495—502. — doi:10.1016/j.mam.2006.08.005. — PMID 16973206.
  • Kornfeld S., Mellman I. The biogenesis of lysosomes (англ.) // Annu. Rev. Cell Biol.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 5. — P. 483—525. — doi:10.1146/annurev.cb.05.110189.002411. — PMID 2557062.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400