PTGFRN

PTGFRN
Идентификаторы
ПсевдонимыPTGFRN, CD315, CD9P-1, EWI-F, FPRP, SMAP-6, prostaglandin F2 receptor inhibitor
Внешние IDOMIM: 601204 MGI: 1277114 HomoloGene: 7908 GeneCards: PTGFRN
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме PTGFRN
Расположение в геноме PTGFRN
Локус1p13.1Начало116,909,916 bp[1]
Конец116,990,353 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме PTGFRN
Расположение в геноме PTGFRN
Локус3|3 F2.2Начало100,947,548 bp[2]
Конец101,017,594 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • left uterine tube

  • saphenous vein

  • secondary oocyte

  • germinal epithelium
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • right lung lobe

  • endocardial cushion

  • left colon

  • epithelium of stomach
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
Компонент клетки
  • поверхность клетки
  • аппарат Гольджи
  • endoplasmic reticulum membrane
  • эндоплазматический ретикулум
  • мембрана
  • клеточная мембрана
  • часть мембраны
Биологический процесс
  • lipid droplet organization
  • myoblast fusion involved in skeletal muscle regeneration
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

5738

19221

Ensembl

ENSG00000134247

ENSMUSG00000027864

UniProt

Q9P2B2

Q9WV91

RefSeq (мРНК)

NM_020440

NM_011197

RefSeq (белок)

NP_065173

NP_035327

Локус (UCSC)Chr 1: 116.91 – 116.99 MbChr 3: 100.95 – 101.02 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

PTGFRN (англ. Prostaglandin F2 receptor negative regulator, отрицательный регулятор рецептора простагландина F2; CD315) — мембранный белок. Продукт гена человека PTGFRN[5][6].

Функции

Белок ингибирует связывание простагландина F2α (PGF2-альфа) со своим специфическим рецептором FP за счёт снижения количества рецептора, не меняя аффинность взаимодействия лиганд-рецептор. В миобластах PTGFRN взаимодействует с тетраспанинами CD9 и CD81, предотвращая слияние миобластов в процессе мышечной регенерации.

Структура

PTGFRN состоит из 879 аминокислот, молекулярная масса 98,6 кДа. Содержит 9 участков N-гликозилирования.

Взаимодействия

PTGFRN взаимодействует с CD9[7][8] и CD81.[7][8].

Тканевая специфичность

Белок экспрессирован в большинстве органов, самый высокий уровень экспрессии обнаружен в сердечной мышце правого предсердия.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134247 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027864 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Orlicky D. J., Berry R., Sikela J. M. Human chromosome 1 localization of the gene for a prostaglandin F2alpha receptor negative regulatory protein (англ.) // Hum Genet : journal. — 1996. — July (vol. 97, no. 5). — P. 655—658. — doi:10.1007/BF02281878. — PMID 8655148.
  6. ↑ Entrez Gene: PTGFRN prostaglandin F2 receptor negative regulator  (неопр.).
  7. ↑ 1 2 Charrin, S; Le Naour F; Oualid M; Billard M; Faure G; Hanash S M; Boucheix C; Rubinstein E. The major CD9 and CD81 molecular partner. Identification and characterization of the complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — April (vol. 276, no. 17). — P. 14329—14337. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M011297200. — PMID 11278880.
  8. ↑ 1 2 Stipp, C S; Orlicky D; Hemler M E. FPRP, a major, highly stoichiometric, highly specific CD81- and CD9-associated protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — February (vol. 276, no. 7). — P. 4853—4862. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M009859200. — PMID 11087758.

Литература

  • Orlicky D. J. Negative regulatory activity of a prostaglandin F2 alpha receptor associated protein (FPRP) (англ.) // Prostaglandins Leukot. Essent. Fatty Acids : journal. — 1997. — Vol. 54, no. 4. — P. 247—259. — doi:10.1016/S0952-3278(96)90055-1. — PMID 8804121.
  • Orlicky D. J., Lieber J. G., Morin C. L., Evans R. M. Synthesis and accumulation of a receptor regulatory protein associated with lipid droplet accumulation in 3T3-L1 cells (англ.) // J. Lipid Res.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 39, no. 6. — P. 1152—1161. — PMID 9643346.
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K. I., etal. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 7, no. 1. — P. 65—73. — doi:10.1093/dnares/7.1.65. — PMID 10718198.
  • Stipp C. S., Orlicky D., Hemler M. E. FPRP, a major, highly stoichiometric, highly specific CD81- and CD9-associated protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 7. — P. 4853—4862. — doi:10.1074/jbc.M009859200. — PMID 11087758.
  • Charrin S., Le Naour F., Oualid M., etal. The major CD9 and CD81 molecular partner. Identification and characterization of the complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 17. — P. 14329—14337. — doi:10.1074/jbc.M011297200. — PMID 11278880.
  • Clark K. L., Zeng Z., Langford A. L., etal. PGRL is a major CD81-associated protein on lymphocytes and distinguishes a new family of cell surface proteins (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 167, no. 9. — P. 5115—5121. — doi:10.4049/jimmunol.167.9.5115. — PMID 11673522.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — Bibcode: 2002PNAS...9916899M. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Otsuki T., Ota T., Nishikawa T., etal. Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 12, no. 2. — P. 117—126. — doi:10.1093/dnares/12.2.117. — PMID 16303743.
  • Yang X. H., Kovalenko O. V., Kolesnikova T. V., etal. Contrasting effects of EWI proteins, integrins, and protein palmitoylation on cell surface CD9 organization (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2006. — Vol. 281, no. 18. — P. 12976—12985. — doi:10.1074/jbc.M510617200. — PMID 16537545.
  • Sala-Valdés M., Ursa A., Charrin S., etal. EWI-2 and EWI-F link the tetraspanin web to the actin cytoskeleton through their direct association with ezrin-radixin-moesin proteins (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2006. — Vol. 281, no. 28. — P. 19665—19675. — doi:10.1074/jbc.M602116200. — PMID 16690612.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400