CACNA1E

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BXL

Ідентифікатори

Символи

CACNA1E, BII, CACH6, CACNL1A6, Cav2.3, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E, gm139, EIEE69, DEE69

Зовнішні ІД

OMIM: 601013 MGI: 106217 HomoloGene: 20185 GeneCards: CACNA1E

Реагує на сполуку

bepridil hydrochloride monohydrate^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • high voltage-gated calcium channel activity • ion channel activity • calcium channel activity
Клітинна компонента	• voltage-gated calcium channel complex • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана
Біологічний процес	• membrane depolarization during action potential • regulation of insulin secretion • regulation of ion transmembrane transport • membrane depolarization • ion transport • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion transport • chemical synaptic transmission • calcium ion import
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


777


12290

Ensembl


ENSG00000198216


ENSMUSG00000004110

UniProt


Q15878


Q61290

RefSeq (мРНК)


NM_000721 NM_001205293 NM_001205294


NM_009782

RefSeq (білок)


NP_000712 NP_001192222 NP_001192223


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 181.32 – 181.81 Mb

Хр. 1: 154.27 – 154.76 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CACNA1E (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 313 амінокислот, а молекулярна маса — 261 731^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARFGEAVVA	RPGSGDGDSD	QSRNRQGTPV	PASGQAAAYK	QTKAQRARTM
ALYNPIPVRQ	NCFTVNRSLF	IFGEDNIVRK	YAKKLIDWPP	FEYMILATII
ANCIVLALEQ	HLPEDDKTPM	SRRLEKTEPY	FIGIFCFEAG	IKIVALGFIF
HKGSYLRNGW	NVMDFIVVLS	GILATAGTHF	NTHVDLRTLR	AVRVLRPLKL
VSGIPSLQIV	LKSIMKAMVP	LLQIGLLLFF	AILMFAIIGL	EFYSGKLHRA
CFMNNSGILE	GFDPPHPCGV	QGCPAGYECK	DWIGPNDGIT	QFDNILFAVL
TVFQCITMEG	WTTVLYNTND	ALGATWNWLY	FIPLIIIGSF	FVLNLVLGVL
SGEFAKERER	VENRRAFMKL	RRQQQIEREL	NGYRAWIDKA	EEVMLAEENK
NAGTSALEVL	RRATIKRSRT	EAMTRDSSDE	HCVDISSVGT	PLARASIKSA
KVDGVSYFRH	KERLLRISIR	HMVKSQVFYW	IVLSLVALNT	ACVAIVHHNQ
PQWLTHLLYY	AEFLFLGLFL	LEMSLKMYGM	GPRLYFHSSF	NCFDFGVTVG
SIFEVVWAIF	RPGTSFGISV	LRALRLLRIF	KITKYWASLR	NLVVSLMSSM
KSIISLLFLL	FLFIVVFALL	GMQLFGGRFN	FNDGTPSANF	DTFPAAIMTV
FQILTGEDWN	EVMYNGIRSQ	GGVSSGMWSA	IYFIVLTLFG	NYTLLNVFLA
IAVDNLANAQ	ELTKDEQEEE	EAFNQKHALQ	KAKEVSPMSA	PNMPSIERDR
RRRHHMSMWE	PRSSHLRERR	RRHHMSVWEQ	RTSQLRKHMQ	MSSQEALNRE
EAPTMNPLNP	LNPLSSLNPL	NAHPSLYRRP	RAIEGLALGL	ALEKFEEERI
SRGGSLKGDG	GDRSSALDNQ	RTPLSLGQRE	PPWLARPCHG	NCDPTQQEAG
GGEAVVTFED	RARHRQSQRR	SRHRRVRTEG	KESSSASRSR	SASQERSLDE
AMPTEGEKDH	ELRGNHGAKE	PTIQEERAQD	LRRTNSLMVS	RGSGLAGGLD
EADTPLVLPH	PELEVGKHVV	LTEQEPEGSS	EQALLGNVQL	DMGRVISQSE
PDLSCITANT	DKATTESTSV	TVAIPDVDPL	VDSTVVHISN	KTDGEASPLK
EAEIREDEEE	VEKKKQKKEK	RETGKAMVPH	SSMFIFSTTN	PIRRACHYIV
NLRYFEMCIL	LVIAASSIAL	AAEDPVLTNS	ERNKVLRYFD	YVFTGVFTFE
MVIKMIDQGL	ILQDGSYFRD	LWNILDFVVV	VGALVAFALA	NALGTNKGRD
IKTIKSLRVL	RVLRPLKTIK	RLPKLKAVFD	CVVTSLKNVF	NILIVYKLFM
FIFAVIAVQL	FKGKFFYCTD	SSKDTEKECI	GNYVDHEKNK	MEVKGREWKR
HEFHYDNIIW	ALLTLFTVST	GEGWPQVLQH	SVDVTEEDRG	PSRSNRMEMS
IFYVVYFVVF	PFFFVNIFVA	LIIITFQEQG	DKMMEECSLE	KNERACIDFA
ISAKPLTRYM	PQNRHTFQYR	VWHFVVSPSF	EYTIMAMIAL	NTVVLMMKYY
SAPCTYELAL	KYLNIAFTMV	FSLECVLKVI	AFGFLNYFRD	TWNIFDFITV
IGSITEIILT	DSKLVNTSGF	NMSFLKLFRA	ARLIKLLRQG	YTIRILLWTF
VQSFKALPYV	CLLIAMLFFI	YAIIGMQVFG	NIKLDEESHI	NRHNNFRSFF
GSLMLLFRSA	TGEAWQEIML	SCLGEKGCEP	DTTAPSGQNE	NERCGTDLAY
VYFVSFIFFC	SFLMLNLFVA	VIMDNFEYLT	RDSSILGPHH	LDEFVRVWAE
YDRAACGRIH	YTEMYEMLTL	MSPPLGLGKR	CPSKVAYKRL	VLMNMPVAED
MTVHFTSTLM	ALIRTALDIK	IAKGGADRQQ	LDSELQKETL	AIWPHLSQKM
LDLLVPMPKA	SDLTVGKIYA	AMMIMDYYKQ	SKVKKQRQQL	EEQKNAPMFQ
RMEPSSLPQE	IIANAKALPY	LQQDPVSGLS	GRSGYPSMSP	LSPQDIFQLA
CMDPADDGQF	QERQSLEPEV	SELKSVQPSN	HGIYLPSDTQ	EHAGSGRASS
MPRLTVDPQV	VTDPSSMRRS	FSTIRDKRSN	SSWLEEFSME	RSSENTYKSR
RRSYHSSLRL	SAHRLNSDSG	HKSDTHRSGG	RERGRSKERK	HLLSPDVSRC
NSEERGTQAD	WESPERRQSR	SPSEGRSQTP	NRQGTGSLSE	SSIPSVSDTS
TPRRSRRQLP	PVPPKPRPLL	SYSSLIRHAG	SISPPADGSE	EGSPLTSQAL
ESNNACLTES	SNSPHPQQSQ	HASPQRYISE	PYLALHEDSH	ASDCGEEETL
TFEAAVATSL	GRSNTIGSAP	PLRHSWQMPN	GHYRRRRRGG	PGPGMMCGAV
NNLLSDTEED	DKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Mori M.X., Vander Kooi C.W., Leahy D.J., Yue D.T. (2008). Crystal structure of the CaV2 IQ domain in complex with Ca2+/calmodulin: high-resolution mechanistic implications for channel regulation by Ca2+. Structure. 16: 607—620. PMID 18400181 DOI:10.1016/j.str.2008.01.011

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1392 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15878 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані